あ、あと、②でチェックしたチャンネルも対象になります。

ツールを使った今まで全部の人の
「自分のチャンネル 一覧」に登録したチャンネル、
「相手のチャンネル 一覧 v2」に登録したチャンネル、
が対象になります。
誰も登録していないチャンネルはデータベースに入っていません。
なので、使う人が少ないうちは、あまり便利ではないですが、使う人が増えればより便利になります。

一覧に出てくるチャンネルは誰かがこのツールに登録した一部のチャンネルしか出てこないんですか?

はい。分かります。
チャンネルID、チャンネルURLのいずれかを入力して、「追加していない②をチェックする」ボタンを押してください。
そのボタンは、「自分のチャンネル 一覧」タブ「相手のチャンネル 一覧 v2」タブにあります。

但し、相手のチャンネルがその設定で、「すべての登録チャンネルを非公開にする」がオフになっている必要があります。